ZEN 2011

Traitement des images

ZEN

Colocalisation

Le module de colocalisation peut être utilisé pour dissocier les signaux se chevauchant de différents canaux de fluorescence.
Pour ce faire, le logiciel ZEN utilise des méthodes modernes telles que la méthode de la valeur de seuil automatique de Costes et al. Des résultats expressifs sur la colocalisation des protéines peuvent être obtenus sous la forme d'un nuage de points, d'une image et d'un tableau de données

Si vous ne souhaitez analyser que certaines zones de l'image, vous pouvez simplement marquer la région correspondante directement dans l'image et le nuage de points. La colocalisation spectrale pour ZEN fournit ensuite les données à la fois pour l'ensemble de l'image et les régions sélectionnées.
Vous pouvez bien évidemment aussi exporter vos valeurs mesurées au format CSV et les traiter à l'aide d'un tableur.

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Deconvolution

Du fait des propriétés optiques du système de microscope, la lumière en provenance des zones au-dessus et au-dessous du plan focal pénètre également dans l'image. Cela signifie que les structures fines sur l'échantillon ne peuvent plus être triées.

C'est précisément ici que le module logiciel Deconvolution 3D commence par calculer la lumière parasite dans la pile d'images jusqu'à son lieu d'origine. La structure de l'échantillon déformé est dépliée et s'affiche plus nettement. Cette technique permet également de réduire tout bruit d'image qui peut être présent, contribuant ainsi de manière décisive à une qualité d'image supérieure de vos piles d'images et de modèles 3D.

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3D VisArt

Avec 3D VisArt, vous pouvez afficher des piles d'images multidimensionnelles sous forme de modèles de volume 3D. Le module ZEN traite jusqu'à 8 canaux différents et, outre les coordonnées de l'image spatiale, prend également en compte les informations en time lapse relatives à vos images.

Vous pouvez positionner de manière interactive un modèle en trois dimensions calculé en fonction du point de vue dont vous avez besoin et lui attribuer des annotations, des coordonnées et des axes d'échelle. Il va sans dire que 3D VisArt vous permet également de disposer de puissants outils pour la mesure interactive des distances et des angles. Vous souhaitez ensuite présenter ou publier le résultat ? Dans l'affirmative, il vous suffit d'exporter les images et les animations dans les formats d'image courants tels que TIF, JPG ou AVI.

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