Le module logiciel ZEN Intellesis facilite l'utilisation du machine learning : il vous suffit de charger votre image, de définir vos classes, d'étiqueter les pixels, d'entraîner votre modèle et d'effectuer la segmentation de l'image. Pour des tâches courantes telles que la segmentation du noyau, on peut même importer un modèle pré-entraîné, qui peut être utilisé pour segmenter et analyser des ensembles de données complets. De plus, il est même possible d‘entraîner votre propre réseau et de l‘importer dans ZEN. (La création de réseaux pré-entraînés personnalisés est également disponible en tant que service payant). ZEN Intellesis est entièrement intégré dans le cadre d'analyse d'image de ZEN Blue et du logiciel d'imagerie de base ZEN et prend en charge les scripts. Cette intégration garantit que toutes les précieuses métadonnées restent connectées et sont disponibles pour les étapes de traitement ultérieures.