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CZI

Format d'image pour microscopes

CZI Le format de fichier d'image par ZEISS

CZI

Toutes vos précieuses données dans un seul fichier. Sécurisées et reproductibles.

Le format de fichier CZI a été développé par ZEISS pour répondre spécifiquement aux exigences de l'imagerie en microscopie. Le logiciel d'imagerie ZEN enregistre les images multidimensionnelles comme les time-lapse, les piles Z, les expériences multipositions et les lames virtuelles dans ce format. CZI combine vos données d'image avec toutes les méta-données pertinentes en un seul fichier compact. 

Un nombre croissant de projets et d'entreprises utilisent déjà et prennent en charge le format CZI avec leurs applications: :

 

  • Logiciels OME Bio-Formats et Glencoe
  • ImageJ
  • Fiji
  • Visiopharm
  • Bitplane/Imaris
  • Da-Cons
  • HS-Analysis
  • arivis AG / arivis Browser / arivis Vision 4D
  • Micro Brightfield
  • Indica Labs
  • Tissue Gnostics
  • Definiens

 

Des métadonnées toujours disponibles.

En plus de l'image, les métadonnées suivantes sont stockées dans le fichier :

  • date d'acquisition, mots-clés, commentaires des utilisateurs
  • type et réglages du microscope
  • intensités du laser ou d'éclairage
  • dimensions et barres d'échelle
  • contrastes et objectifs utilisés
  • colorants et filtres de fluorescence
  • positions de la platine (x, y) et de la mise au point (z)
  • paramètres de la caméra et du détecteur, comme les valeurs d'exposition, le binning, la profondeur de bits, le temps de maintien par pixels
  • éléments graphiques automatiques ou définis par l'utilisateur et annotations
  • informations de code à barres de l'échantillon

Ces informations sont toujours disponibles, ce qui signifie que votre image est toujours reproductible dans des conditions identiques, même des années plus tard. Si vous avez besoin de partager ces images avec vos collègues, notre logiciel gratuit ZEN lite leur permet de visualiser et de traiter vos images au format CZI.

Si vous souhaitez également traiter et analyser vos images CZI à l'aide d'autres logiciels, nous serons heureux de vous fournir à cet effet la documentation du format de fichier CZI interne. Veuillez cliquer sue le lien d'inscription à droite pour recevoir votre licence de documentation (gratuitement) après avoir rempli notre formulaire d'inscription de développeur CZI. Nous vous enverrons ensuite la documentation.

Logiciels libres pour la recherche ouverte.

Le logiciel ZEN et les postes de travail d'imagerie de microscopie ZEISS sont conçus pour fonctionner sur des plateformes Microsoft Windows 64 bits. Pour vous assister sur d'autres systèmes d'exploitation tels que Mac OS X ou Linux, ZEISS offre de la documentation pour l'interopérabilité et a en outre établi des coopérations avec des projets et des entreprises partenaires.

Les images créées avec le logiciel ZEN et les systèmes de microscopie ZEISS sont enregistrées dans le format de fichier CZI entièrement documenté. Si vous souhaitez afficher et traiter les données qui ont été créés dans ce format sur des plates-formes non Windows, nous vous recommandons de visiter les pages d'accueil du projet ImageJ et du progiciel Fiji qui se base sur ImageJ. Des fichiers d'installation précompilés de ces programmes d'imagerie open source sont disponibles pour Mac OS X et plusieurs distributions de Linux, ainsi qu'une multitude de plug-ins pour l'analyse et le traitement. L'importation des images CZI et des métadonnées est prise en charge par le plug-in Bio-Formats de l'environnement Open Microscopy.

Merci de comprendre que ZEISS Microscopy ne peut pas fournir une quelconque assistance au niveau utilisateur pour ces applications. En revanche, ZEISS soutient des projets et des communautés de logiciels ouverts avec un accès aux développeurs, la documentation et les SDK pour les produits de microscopie sélectionnés. Si vous êtes un développeur intéressé, vous pouvez vous inscrire gratuitement pour avoir accès à la documentation CZI.

Contactez dès maintenant votre interlocuteur chez ZEISS pour en savoir plus sur CZI !

 

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